主任：负责日常运行管理、战略规划、资源统筹及对外协调。负责外部专家的聘用、管理，运行经费的使用管理，设备的更新、引进，研究中心用房调配，以及协调各研究方向的合作。
常务副主任：协助主任开展日常管理工作，分管技术研发与成果转化。组织学术年会，研究、发布实验室开放课题指南，确定工程研究中心的技术发展方向。
学术委员会：审议工程研究中心的研究方向、审查重大研究课题的申请报告、发布开放课题指南、审批与管理开放课题、审议工程中心的重大学术交流活动。
综合办公室：负责中心的综合事务管理，行政管理、会议组织、文件档案管理、仪器设备管理、后勤保障等，为中心的正常运转提供全方位支持。
项目管理办公室：跟踪中心的项目管理工作，组织纵向/横向课题申报与验收，项目过程跟踪与管理，产学研合作对接等。